Не без помощи денег Дон Жуан убеждает Лепорелло остаться у него на службе и рассказывает ему о своей очередной афере: он намеревается соблазнить служанку Донны Эльвиры, но для этого госпожу нужно отвлечь. Жуан и Лепорелло меняются одеждой. Завидев Эльвиру в окне, Лепорелло голосом Дона Жуана просит прощения и клянется ей в вечной любви. Женщина ловится на удочку заговорщиков, поддается былым чарам и уходит с переодетым в хозяина Лепорелло. Жуан бросается соблазнять служанку.
Однако его план в очередной раз нарушен: в сопровождении вооруженных крестьян появляется Мазетто с намерением отомстить за Церлину. По-прежнему в обличье Лепорелло, Жуан обманывает крестьян, отправляя их по ложному следу, а Мазетто он уговаривает отдать ему оружие, после чего избивает беднягу. Церлина находит израненного жениха и принимается утешать его.
Окончательно уставший от проделок хозяина, Лепорелло плутает в темноте с Донной Эльвирой. В попытке сбежать от нее он сталкивается с Анной, Оттавио, Церлиной и Мазетто. Несмотря на мольбы Эльвиры, четверка решительна в своих намерениях отомстить, как они считают, единственному виновному во всех их горестях – Дону Жуану. Лепорелло признается, что он вовсе не свой хозяин, а его переодетый слуга, молит о пощаде, и в конце концов сбегает от преследователей. Оттавио окончательно убеждается в том, что Жуан – истинный убийца Командора и обидчик Анны. Эльвира, несмотря на причиненное Жуаном зло, признается себе, что все еще испытывает к нему чувства.
Дон Жуан и Лепорелло встречаются на могиле Командора. Жуан похваляется своим очередным «подвигом», как вдруг раздается голос Командора, угрожающий ему скорой смертью. Жуан решает пригласить призрака-статую на ужин. Призрак соглашается.
Оттавио требует от Анны скорейшего брака, но та просит его дать ей больше времени, так как смерть ее отца до сих пор не отомщена.
Дон Жуан ужинает в одиночестве. Лепорелло прислуживает, музыканты развлекают господина. Входит Эльвира с призывом прекратить злодейства, но в ответ она слышит только насмешки. Покидая комнату, женщина издает страшный крик: к Дону Жуану явился каменный гость с обличьем Командора. Дон Жуан в ужасе. Очередь каменного гостя пригласить Жуана отужинать с ним, но сперва гость просит мужчину подать ему руку в знак согласия. Дон Жуан подает ему руку, но тут же понимает, что не может освободиться. Все призывы раскаяться в грехах не приводят к успеху, конец злодея близок.
Появляются остальные герои, и Лепорелло рассказывает им о произошедшем. Полагая, что небеса отомстили Дону Жуану за содеянное зло, герои размышляют, что же будет дальше.